Yunanistan'ın Batı Trakya'daki Türk azınlık için Gümülcine ve İskeçe müftülüklerine merkezi otoriteyi atadığı uygulaması, söz konusu topluluğun dinî temsilcilerini seçme hakkının ihlali olarak değerlendirilmektedir. Bu tür atamalar, yıllara yayılmış olsa bile bir hukuksuzluğun normalleştirilmesi anlamına gelmektedir.
Batı Trakya Türkleri için müftülük kurumu, dinî yaşamın, toplumsal bütünlüğün ve kültürel kimliğin temel unsurlarından biridir. Lozan Barış Antlaşması ve uluslararası hukuk çerçevesinde korunan bu hakların, azınlığın iradeleri göz ardı edilerek kısıtlanmasının sonlandırılması gerektiğini belirten YTB, Yunanistan'ı dayatmacı tutumlarını terk etmeye ve Batı Trakya Türklerinin kendi seçtikleri müftüleri resmi olarak tanımaya çağırmaktadır. Kurum, bölgedeki soydaşlarının haklı mücadelesine desteğini sürdüreceğini ifade etmiştir.
